一、纳税人总机构在北京，分支机构在西部大开发优惠税率地区，在填报企业所得税年报时，应该如何填写总分支机构适用不同税率而产生的税款差异？

　　答：根据《税务总局关于印发跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法>的公告》（税务总局公告2016年第57号）规定：“第十八条对于按照税收法律、法规和其他规定，总机构和分支机构处于不同税率地区的，先由总机构统一计算全部应纳税所得额，然后按本办法第六条规定的比例和按第十五条计算的分摊比例，计算划分不同税率地区机构的应纳税所得额，再分别按各自的适用税率计算应纳税额后加总计算出汇总纳税企业的应纳所得税总额，*后按本办法第六条规定的比例和按第十五条计算的分摊比例，向总机构和分支机构分摊就地缴纳的企业所得税款。”

　　二、企业员工的个人所得税由企业承担，请问是否可以在企业所得税税前扣除？

　　答：按照《税务总局关于雇主为雇员承担全年一次性奖金部分税款有关个人所得税计算方法问题的公告》（税务总局公告2016年第28号）的规定，企业为员工负担的个人所得税款，应属于个人工资薪金的一部分。凡单独作为企业管理费列支的，在计算企业所得税时不得税前扣除。

　　三、居民企业以非货币性资产对外投资应于何时确认转让收入？

　　答：根据《财政部税务总局关于非货币性资产投资企业所得税政策问题的通知》（财税〔2016〕116号）第二条的规定：“企业以非货币性资产对外投资，应于投资协议生效并办理股权登记手续时，确认非货币性资产转让收入的实现。”

　　因此，居民企业以非货币性资产对外投资，应于投资协议生效并办理股权登记手续时，确认非货币性资产转让收入的实现。